EXCAVATOR Error - Magic Numbers

Question

[mafonso]

Hi all,

I am testing the EXCAVATOR tool for detecting CNVs and came across this error message:

Program folder is: /home/mafonso/Escritorio/EXCAVATOR_Package_v2.2/EXCAVATOR

Checking output folders...
'/home/mafonso/Escritorio/EXCAVATOR_Package_v2.2/EXCAVATOR/OUTfolder' folder ready!
Checking output subfolders...
'/home/mafonso/Escritorio/EXCAVATOR_Package_v2.2/EXCAVATOR/OUTfolder/Data' folder ready!
'/home/mafonso/Escritorio/EXCAVATOR_Package_v2.2/EXCAVATOR/OUTfolder/Results' folder ready!
'/home/mafonso/Escritorio/EXCAVATOR_Package_v2.2/EXCAVATOR/OUTfolder/Plots' folder ready!
Working on sample ContrID.
Checking sample 'ContrID' folders...
...done!
Now working with SAMtools...
Removing temporary files...
...done!
Working on sample SmpID.
Checking sample 'SmpID' folders...
...done!
Now working with SAMtools...
Removing temporary files...
...done!
Error: número mágico de archivo de restauración inválido (el archivo puede estar dañado) -- ningún dato recargado
Además: Mensajes de aviso perdidos
file 'chr1.Ex_GCC.txt' has magic number '000'
  Use of save versions prior to 2 is deprecated
Ejecución interrumpida
Read 23 items
Error en splitind2:length(seqChrom) : Argumento NA/NaN
Ejecución interrumpida
Error en file(file, "rt") : no se puede abrir la conexión
Calls: read.table -> file
Además: Mensajes de aviso perdidos
In file(file, "rt") :
  no fue posible abrir el archivo '/home/mafonso/Escritorio/EXCAVATOR_Package_v2.2/EXCAVATOR/OUTfolder/Results/SmpID/HSLMResults_SmpID.txt': No existe el archivo o el directorio
Ejecución interrumpida
Analyzed samples:
ContrID SmpID

I'm sorry some messages are in spanish. The first error message in english is

bad restore file magic number (file may be corrupted) -- no data loaded

Can someone help me?

Thanks